最后在内兹比战役溃不成军的时候，又化妆逃离司令部，前往苏格兰与誓约派部队的兵营。
而誓约派与英格兰议会军结盟，在查理拒绝承诺在英格兰建立长老派制度的教会的时候誓约派将他交给了英格兰议会。
1647年查理一世落入了托马斯·费尔法克斯和奥利弗·克伦威尔统率的、打了胜仗的圆颅党手中。
费尔法克斯和克伦威尔都急于和国王在书面宪法的基础上言和。
他们草拟了一份“建议提纲”，查理的一些顾问也认为这是战败后重新获得权威的途径。
但是查理不去想怎么达成协议，而是对敌方挑拨离间。查理从汉普顿宫的软禁中逃到了怀特岛，在那里他一面与议会派谈判一面与苏格兰臣民讨价还价。
此时，议会派中有真正的和平派，而苏格兰臣民中也有相当部分的人不愿将自己的国王囚禁起来，准备起兵勤王换取宗教上的让步。
查理接受勤王，苏格兰勤王军1648年进入英格兰，同年，很多被清教徒限制和勒索的王党派重新武装起来。
但是克伦威尔打败了苏格兰勤王军，费尔法克斯打败了王党派。
王后逃亡法国寻求援助，遭到执政的法国首相马扎然红衣主教的冷落。
由于认定国王对人民发动战争，军事领袖们决定国王必须接受审判。
下院这时也清洗了与怀特岛上的查理议和的和平派。
一个高级法庭建立起来，国王被带到威斯敏斯特大厅受审。
由于查理一世从最开始就不承认这个法庭的合法性，因而也不为自己的行为认真辩护。
135名特别法庭中成员中59人签署了由克伦威尔下达的处死国王的命令。
罪名是背叛他的国家，背叛他的人民。
1649年一月查理一世面带微笑，态度从容走向断头台，为了维持自己王者的尊严，冷静的说：
“死亡对我并不可怕，感谢上苍，我已准备好了。”
他先朗诵了自己做的一首诗，然后泰然自若的称自己是人民的殉道者，自己走到断头台前，结束了49岁的一生。
有趣的是，他还要求穿两件衬衣，以免冷得发抖使人们认为他是在害怕。一周后尸体被秘密埋在温莎城堡。
这就是历史上的英格兰国王查理一世，现在历史进程已经被大明皇帝改变。
大明两年前出兵帮助他战胜起义军，让他多活了几年，他
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