真相之后会不会选择和他父亲一样的道路呢？
肯特表示可以告诉他真相：“是关于你母亲失踪的真相。”
“我母亲已经死了。”是死了但只有一个衣冠冢，不过回想起来碇真嗣还真不记得母亲是怎么死的了。虽然当年他其实就在现场亲眼看到初启动的母亲溶解，但他选择遗忘。
“应该说死了一半吧，她的灵魂还在初号机了，让你来驾驶初号机不是没有原因的，因为你的母亲就在里面。”
咔嚓，少年的心碎了一地，虽然他一直在问‘为什么是他’，但知道真相的时候，答案却实在难以接受。自己的母亲就是初号机？
连罗素都觉得这事情耸人听闻，可是超人也没有理由骗他们啊。
真相，有时候不知道才是最好的。
碇真嗣已经被真相打击得要六神无主七上八下了，父亲伟大的事业之后还有毁灭人类的目的。母亲就是初号机，所以初号机才会保护自己。
虽然解释了一切的问题，可是碇真嗣反而更加迷茫了，现在他该怎么做？做父亲的帮凶，还是违抗父亲？
优柔寡断的碇真嗣最不擅长的就是选择，更不要说这种重大的选择了。
“可是为什么他们必须要融合人类，难道我们现在不好么？”罗素问道。
“那是人类的先祖记载的，他们认为人类融合是人类最终的阶段。”其实人类祖先有着和使徒一样的本能：“不过我不认为这是唯一的结果，所以才会出现使徒之环，我希望通过你们去寻找其他的可能性。”“人类就算不融合也一样伟大，就拿二子山作战来说，你们也一定感受到了万众一心的威力了吧？”人类和使徒还是有不同的，先祖的本能在现代也单薄了，时代是变化的，人类都要走向宇宙了，人类先祖记录的最终结果也会过时的。
没有大家的帮忙，作战确实不能成功，他们的胜利背后有无数人的汗水。
“没错，虽然世界被我们搞乱了，不过我们人类可以弥补，不能选择融合。说的好听，其实那只是想要逃避，我们人类的存在不仅仅是关乎我们人类自己，还有地球的未来。”罗素是有大胸怀的人，他认为人类不能逃避自己的责任，把地球搞得一塌糊涂一走了之，那是不可取的。
肯特怀疑罗素是不是十五的孩子，这见解相当有大局观。
可惜碇真嗣还是深陷家庭伦理悲剧的选择中，不知道怎么办。他想要逃走，离开第三新东京市，逃的远远的，远离这些事实。老办法了，做鸵鸟，对
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