贞观十年，阿史那社尔决心到长安作唐朝的将军。自贞观十二年以来，阿史那社尔在高昌的统治地位被西.突.厥东部联盟的首领都陆可汗所取代。由于都陆的支持，高昌王麴文泰才敢于藐视大唐。从西方带着货物前往长安的商人不能继续前进，高昌以西各国给大唐的贡礼也被麴文泰截留了。
由于这些困难，贞观十二年皇帝准许高昌西南的另一个绿洲小国焉耆另开一条横越沙漠的南路。
麴文泰于是联合西.突.厥攻击焉耆和另一个绿洲小国伊吾。伊吾位于高昌之东，为通往长安的必经之路，受到攻击的理由是伊吾对西.突.厥的态度转冷，而转向于效忠大唐。
贞观皇帝接到伊吾的求援信，当即命令麴文泰作为一个藩臣亲自来朝，但麴文泰置之不理。贞观十二年阴历十二月，皇帝命侯君集率军远征高昌。
起初麴文泰认为，唐军跨越这么广大的沙漠地带远征他的王国是件可笑的事情，但他没有料到侯君集的坚毅精神、和彪悍的战力。当他听到唐军已快速逼近时，据说是因为极度的惊恐而死。
西.突.厥曾答应高昌，如果高昌遭到进攻就给予援助，于是便派出了一支援军。但这支援军在唐军到达时竟转头逃跑。贞观十四年阴历八月，麴文泰的儿子——新高昌王举国向侯君集投降。
皇帝决心把高昌并为大唐的一部分，而不仅仅把它当作一个蕃属。魏徵和褚遂良二人极力反对直接统治这个绿洲，因为它离长安太远，需要很多军队驻守，在征集戍兵和供应上都有困难。
魏徵坚决否认这个地方的归并能使大唐得到任何的实利。但皇帝对这个劝告置之不理——因为一条丝路的价值不是谁都能认识到的。于是高昌成了大唐的一个州——西州。
西州是大唐巩固丝路的一个战略支撑点，因而西州都督绝不仅仅是内地的一个州刺史可比，他要兼管一州文、武两方面的事务，而且掌握着一支常备军队，所辖的区域也极为广袤，从甘、肃以西的沙州，直到西面的焉耆边境。
焉耆自贞观六年以来就向大唐朝贡，可是它很快因大唐在紧靠它的、相距不到五百里的西州设立都督府、驻军而不安。因此，焉耆和西.突.厥联盟，并停止向大唐朝贡，而且也学着高昌的做法，对南路上经过的客商课以重税、截留贡礼。
结果，在贞观十八年后期，西州大都督郭孝恪出征焉耆，俘虏了国王。而龟兹的援兵都没敢象模象样的露面，焉耆便纳入了西州。
焉耆的西面六百里就
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