便是英国公军机大臣张惟贤、成国公朱纯臣相继派人说和也没有用，根本不给京师勋贵武臣一点面子，限定的最后期限一过，立马提笔给皇帝上了密折，说明了实情。
对京营的情况，朱大明有心理准备，所以并没有太意外。而这也的确是整顿京营的一个契机，只是京营牵扯了太多勋贵武臣，轻易不能擅动，英国公张惟贤总督京师三大营，而成国公朱纯臣提督五军营，丰城侯李承祚提督三千营，新乐侯刘效祖与总兵朱国彦共掌神机营。
其中除了丰城侯李承祚涉魏党被抓以外，其他的都不能重处。尤其新乐侯刘效祖，他是崇祯皇帝生母刘氏的亲弟弟，也就是崇祯皇帝的亲舅舅，其子刘文炳后来继承了新乐侯的爵位，崇祯死后，刘文炳与巩永固受命护送崇祯皇帝的太子出城，结果失败，全家殉节而死。所以接到文震孟的密折之后，朱大明想来想去，最后决定把三千营的责任归咎于丰城侯李承祚，以勾结魏逆、欺君罔上、贪墨军饷之罪，将其抄家斩首，家人流放云南；将五军营、神机营的责任归咎于之前的监军内臣和坐营中官，共十二人，一律抄家斩首，并下旨申斥英国公张惟贤、成国公朱纯臣和新乐侯刘效祖，一律罚俸一年。
对于文震孟密折里请示剩余饷银如何处置的问题，朱大明则在给文震孟的旨意中，令他用剩余的饷银重新招募一万八千人，从三大营选官训练三个月，然后以一万五千人充实三大营，再以三千人新建一个监军标营，由监军御史直领，免得监军御史说话没有分量。
与文震孟看到的情况大同小异，带着尚方剑的倪元璐、施邦曜，分别到达任所之后，也是采取逐营发饷、逐人发饷的办法，经过半个月的辛劳，终于摸清了宣府和蓟镇的情况，空饷的问题当然存在，但是要比京营好一点，空饷的额度都在两成左右，而这些空饷倒也不是纯粹贪污挥霍了，而是用来养家丁。
营兵是朝廷的，而家丁是自己的，所以多数边镇将领喜欢把更多的军饷挪用过来养家丁，这也是边镇普遍存在空饷问题的原因。好在这些家丁将来还是要上阵的，很多家丁队伍到了关键时刻还能发挥重要的作用。这一点与京营比显然要好一点，因为京营的空饷，就是将领纯粹的贪墨，他们不需要像边镇将领那样养家丁战场保命。
但是即便算上了将领的家丁，宣府和蓟镇也还是有空饷，倪元璐核算之后密折上报宣府镇营兵兼卫所兵实有员额一万七千人，空饷三千人。
施邦曜所在的蓟镇三屯营、建昌营营兵兼卫所兵实有一万六千人，空饷四千
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