当初科尔沁部主要的驻牧之地，就是在捕鱼儿海的周边。
这个捕鱼儿海，就是如今的贝尔湖，捕鱼儿海的周边，指的主要的就是如今的呼伦贝尔一带。
然而，随着历史的变迁，科尔沁逐渐发展壮大，其中的一支越过了哈喇温山，一路往东、往南迁徙，逐渐来到了脑温江流域，并沿着脑温江一路往南繁衍，经过百十年的发展，形成了科尔沁的另一个大支，叫作脑温科尔沁。
原来留在捕鱼儿海周边的科尔沁人，被称作阿鲁科尔沁。阿鲁是北方的意思，阿鲁科尔沁，就是北方的科尔沁人。而脑温江，也叫那兀江，后来又被音译为汉语嫩江，而脑温科尔沁因此也叫嫩科尔沁。
到了明朝后期的时候，因为北方气候的变化，冬季更加严寒，脑温科尔沁不断南下，开始与建州女真部发生冲突，其连着几任首领都站在察哈尔的一边，与女真人为敌，并且多次配合明军进攻女真各部。
然而等到辽东总兵李成梁死后，脑温科尔沁开始离心，再等到明军在萨尔浒之役中大败之后，当时脑温科尔沁的首领明安，就开始与奴儿哈赤停战，并把自己的女儿嫁给了奴儿哈赤，相互之间开始了勾连合作。
这也是科尔沁与后金以及后来满蒙联姻之始。
等到明安死后，科尔沁部的一个台吉奥巴成了脑温科尔沁诸部的首领，而此时，林丹汗又开始不停地往东侵占科尔沁的草原，奥巴随即与奴儿哈赤联手，希望共同对抗察哈尔部的东犯。
奥巴也先后把自己的女儿，嫁给了奴儿哈赤的儿子和侄子们，再之后，脑温科尔沁与建虏之间，相互联姻的越来越多，关系也就越来越紧密。
等到脑温科尔沁诸部与后金联手，打败了黄金家族后裔、蒙古人的共主、察哈尔部的林丹汗之后，脑温科尔沁的首领奥巴，自觉功德圆满，开始自称土谢图汗，并将脑温科尔沁分为左中右三部，每部的首领都封为了台吉，左翼科尔沁的台吉，就是自己的叔父斋桑。
整个科尔沁诸部之中，与后金联姻最多，关系最密切的，也正是这个左翼科尔沁的台吉博尔济吉特氏斋桑家族。而与后金联姻的好处，当然也是左翼科尔沁斋桑所部得到的最多。
原本驻牧在脑温江与松花江交汇之地的左翼科尔沁，如今得以进一步南下，占据了水草最为丰美的两河之地，即纳里特河和西拉木伦河两岸的草原。
而脑温科尔沁的本部，也就是土谢图汗奥巴的领地，依然留在脑温江与松花江的东北部，一处叫作格勒珠尔根的
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