调查发现，当初的九尾之乱，是因为九尾中了幻术，被人控制。
而能够用幻术控制九尾妖狐的，整个忍界只有宇智波一族。
从此以后，宇智波一族背后就背上偷偷发动九尾之乱的罪名。
虽然查不出证据，但是，木叶对宇智波一族的隔阂变大，再加上，最初二代火影，一直对宇智波一族有偏见，因为当年千手一族就是1代火影和2代火影的一族，在没有组成木叶忍者村之前，一直都和宇智波一族有战争，而战争产生的仇恨一直都不可调和。
再加上二代火影对宇智波一族的血脉有深入研究，二代火影是一个喜欢研究禁术的人，鸣人的多重影分身之术、四代火影的飞雷神之术，以及大蛇丸的秽土转生最初都是他研究出来的，他知道宇智波一族的缺陷，所以就在那个时候就把宇智波一族隔离开。
九尾之乱后，更是矛盾达到了极点。
最终出现宇智波一族灭族惨案，阿飞答应宇智波鼬不再对木叶出手，但是宇智波鼬得加入晓组织为他所用，同时，他还在宇智波一族灭族中获得大量的血轮眼。
而这时，晓组织的和平之道，让他产生了兴趣，所以他就不再关心木叶的情况。
至于！
宇智波带土为什么要帮宇智波鼬灭族，原因很简单。
他讨厌战争，首先他自己被巨石砸死，导致没有及时保护野原琳的死，都是因为木叶和雾隐村的战争。
当时宇智波一族想发动内战，宇智波带土本能的厌恶，不问缘由，直接和宇智波鼬一起，将想爆发战争的人给灭的干干净净。
如果不是宇智波鼬，佐助也得死。
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