系铭军向鸡笼靠拢后，清军开始打算包围鸡笼。不过法军的“非洲军团“也有两千余人抵达鸡笼，开始朝暖暖推进，双方决战气氛浓厚。然后便是擦枪走火，双方爆发了鸟嘴峰之役。由于清军迅速增援，法军被迫于隔日撤退。孤拔与李士卑斯皆认为不应在台湾发动陆战，但法国政府为增加将来谈判的筹码，仍要求孤拔至少打赢一场胜仗，并占领鸡笼矿山。中正十年七月，法军外籍军团约三千人抵达鸡笼，法军陆战队总兵力达到近一万三千人左右，足以发动陆战。
七月二十五日，法军李伟林中校指挥十个中队共四千六百名法军四路进攻清军防线，其中一路袭击深澳坑后方，另外三路主力进攻清军守备较弱的月眉山，于是第一次月眉山之役正式爆发。开战之初，驻守月眉山的民团溃败，法军攻占山顶，但隔日张仁贵等人率军反攻，而在深澳坑击败另一路法军的曹志忠、林朝栋也赶来支援，双方展开激烈的攻防战。在曹志忠指挥下，清军逐渐逼退法军，夺回山头，最后两军分别在山顶与山脚下建立碉堡。巩固防御后，曹志忠与林朝栋发动夜袭，双方激战至隔日清晨才撤军，战役方告结束。另一方面，清军将领聂士成率领八百淮军于八月一日赶到，而法军终于攻占狮球岭，清军退守鸡笼河南岸。随后清军多次增援，法军则试图攻占林朝栋镇守的大武仑炮台，但均未成功。
双方休整半月，法军又派出三千人袭击清军防线，月眉山的战火再次燃起。法军先攻陷深澳坑的防御土墙，截断刘朝枯防守的戏台山，随后有击溃了苏得胜派来的八百援军，并包围月眉山的曹志忠本部部队，占领月眉山顶。曹志忠发动反击，将法军稍稍击退，隔日攻打月眉山顶的法军，但却失败，而镇守鸟嘴峰的民团则于当日溃败，法军改由枕头山、竹嵩山和龙潭堵三路围攻曹志宗本部，另外派军由鸟嘴峰深入深澳坑后方，依序击溃苏得胜、镇守刘朝枯与曹志忠等部队。战至八月底，清军仅剩镇守大水窟的林朝栋、四角亭的苏树森未败退，但因主力溃败，两军只好放弃阵地，掩护清军主力撤退至基隆河南岸的暖暖、五堵。刘铭传则亲率八百铭军驰援六堵，而法军则因弹药用尽，加上当晚大雨不停，溪水暴涨，故退至基隆河北岸。
鸡笼战事进展不顺，法国政府停止了增援鸡笼战事，并命孤拔攻占澎湖。孤拔只能率领远东舰队八艘战舰进攻妈宫城，清军将领梁景夫死守四角仔要塞，并以炮轰还击，但法军火力强大，至九月初，整座要塞几乎被夷平，镇守清军死伤惨重、完全瓦解，法军得以顺利占领澎湖。
彻
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