多尔衮、豪格等人率军南下，重新将辽南收复，解除后顾之忧。一切都按照刘烨的设想顺利进行。
外部形势大好，内部形势也不错。没有战争的这段时间，琼海军上下并没有闲着。
临高本土的军队编练已经基本完成，从十几万流民优中选优，挑选了两万青壮作为预备役，一边屯田一边操练，其余人则分散到澄迈、儋州、万县等地垦荒，逐渐开始有了收成，加上对原有的良田代缴赋税，收获颇丰，粮食储备喜人，原来的粮仓都不够用了，新的粮仓在临高新城以南开始动工。
山东方面，苏粗腿干得很出色，在林天明的全力支持下，改编了山东境内原来的营兵，淘汰冗员，精锐编入独立团，消化吸收。半年多下来，整个山东除了卫所以外，营兵都撤销了番号，朝廷的武装力量接近于零，只剩下隶属琼海军的独立团，原本四千不到的规模已经扩充到了一万余人，是原来的两三倍。作为北直隶屏障的山东，已经彻底被解除武装，成了琼海军直接控制的基地，随时可以派遣援军从海上登陆，向京城、陕西、辽东发动攻势，进退自如。
台湾那边又是另一番新气象，朱大典管民、徐一凡管军，把这里打理得井井有条。以台南为中心，一个规模庞大的移民聚居地已经形成，并且随着人数的增加，不断向外扩张，往北接近诸罗山（今台湾省嘉义市），往南抵达打狗（今台湾省高雄市），往东到了阿猴（今台湾省屏东县）。
这些区域原本到了清朝甚至民国以后才慢慢开始开发，现在还是原始状态，勤劳的大陆移民提前让这些地方进入了农耕时代，当然也免不了与阿美族、排湾族、平埔族为代表的原住民发生激烈的冲突。朱大典大肆砍伐森林、武装移民的方法成效显著，原住民的生存环境被破坏，和移民的斗争也逐渐处于下风，他们要么屈服，要么被迫逃入阿里山深处，阿里山脉以西方圆几百里都成了汉人的天下。
而来自陕北的流民不断加入，让徐一凡麾下的准军事人员数量急剧上升，光论人数而言，台南基地的人数已经快赶上大本营临高了。陕北流民与山东等地的饥民不一样，大多有被裹挟加入流寇炮灰部队的经历，打过仗、见过血，培训成军的速度和难度比起后者更有优势。半年多的时间，第二团不仅补充了战损的兵额，以屯丁为主力的预备役部队也达到了两万之多，只是武器装备还远远落后于临高本土——台南不设兵工厂，装备都需要临高提供，而且现在兵工厂的产能显然跟不上部队扩充的速度了。
在刘烨的运筹帷幄下，琼
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