傅斯年是个公认为比较全面的人，不但书教得好，行政工作也是得心应手。在北大，他除主持史语所日常行政工作之外，也承担了北京大学很多的行政工作。
时任北大校长的蒋梦麟回忆说：“九•一八”事变后，北平正在多事之秋，我的“参谋”就是适之和孟真两位，事无大小，都就商于两位。他们两位代北大请到多位国内著名的教授，北大在北伐成功以后之复兴，他们两位的功劳，实在是太大了。那个时期，我才知道孟真办事十分细心，考虑十分周密。
九一八”事变以后，1933年2月日军侵占热河，华北危急。4月，史语所南迁上海，暂时安置于曹家渡的小万柳堂。
次年12月，中央研究院在南京集中兴建的各研究所房舍相继竣工，史语所由上海迁到了南京钦天山北极阁的史语所大厦。
日本军队占领了中国东北三省，进一步向华北地区进犯，威胁平津，中华民族进入了危难之际。
鉴于清末英法联军占领北京火烧圆明园，导致大量价值连城的文物遭到焚毁和劫掠的悲惨命运，考虑到北平故宫等机构保藏的文物有在战火中被焚毁或遭日军抢劫的可能，故宫博物院院长易培基等有识之士，电告南京中央政府，提出了尽快把文物南迁以避刀兵之灾的意见。经过一番周折，终于得到国民政府批准，北平几家存有文物的部门于1932年底商定派员精选文物，紧急装箱南迁。除故宫博物院集中的13427箱零64包外，另有古物陈列所、太庙、颐和园、国子监，以及奉天、热河两行宫等处文物6066箱，由国民政府委托故宫博物院派员一起将其南迁——这便是中国近代史上著名的第一次国宝南迁大行动。
由北平南迁的文物先运到上海暂存，同时利用南京朝天宫旧址，修建故宫博物院南京分院长期存放。因南京分院只能容纳原北平故宫运出的文物，一同运往上海的其他部门如太庙、颐和园等原有6066箱文物无处存放。
经蔡元培倡议，于1933年4月在南京成立了国立中央博物院筹备处，暂时接管这批文物。中央博物院隶属教育部，办公地点设在鸡鸣寺路1号。
中央博物院筹备处成立后，蔡元培出任第一届理事会理事长，傅斯年受教育部长朱家骅之聘，担任中央博物院筹备主任。
中央博物院是第一个近代意义上的国立博物馆，对博物馆事业的发展有着重大的作用，筹建国立中央博物院事关重大，傅斯年不敢怠慢，立即投入到紧张的筹建之中。他首先主持拟定《
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